اعتمد المجلس الأعلى للأزهر ضوابط وشروط إنشاء المعاهد الأزهرية، المقامة بالجهود الذاتية، منعا للمخالفات أو الإخلال بقواعد السلامة للطلاب وأعضاء هيئة التدريس من جانب وللحفاظ على منهج الأزهر والقواعد التى وضعها المجلس الأعلى للأزهر لحماية الاعتدال والوسطية.